181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3898 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2909  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000128307  hitchhiker  0.0000000000424074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3218  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409054  hitchhiker  0.0091644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1177  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105973  hitchhiker  0.000000000000145149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2610  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2193  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427584  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1601  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3536  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00370417  hitchhiker  0.000000304392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2412  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00869744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5028  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1165  tRNA-Met  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1265  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276472  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2264  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.716137  hitchhiker  0.00000000422113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2796  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.466564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1768  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  hitchhiker  0.00809166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  91.8 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0043  tRNA-Met  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0603767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  88.31 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  88.31 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  89.55 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna017  tRNA-Met  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.274857  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00847  tRNA-Met  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3149  tRNA-Met  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000320663  hitchhiker  0.0000000000372776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1850  tRNA-Met  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00244712  hitchhiker  0.00000000792688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  87.32 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  86.49 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  86.49 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  86.49 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3195t  tRNA-Met  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0832  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0007  tRNA-Met  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0078  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0983896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0057  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1521  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1714  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>