83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2909 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1177  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105973  hitchhiker  0.000000000000145149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5028  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2610  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2412  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00869744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1601  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2193  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427584  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2909  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000128307  hitchhiker  0.0000000000424074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3218  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409054  hitchhiker  0.0091644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3536  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00370417  hitchhiker  0.000000304392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1165  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1265  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2796  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.466564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2264  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.716137  hitchhiker  0.00000000422113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1768  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  hitchhiker  0.00809166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3149  tRNA-Met  96.83 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000320663  hitchhiker  0.0000000000372776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1850  tRNA-Met  96.83 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00244712  hitchhiker  0.00000000792688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  88.73 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.45 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0012  tRNA-Met  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097362  normal  0.0784713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  85.71 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0007  tRNA-Met  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  85.71 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0042  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  86.57 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0043  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0603767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  87.72 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3195t  tRNA-Met  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  88.46 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0033  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0412  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159006  normal  0.829895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.459339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510749  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.110584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>