157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0175 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  93.24 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  93.24 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  93.24 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  93.24 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0078  tRNA-Met  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376289  normal  0.616064 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0050  tRNA-Met  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000143302  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0022  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0104  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0018  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0278993  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0114  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00121971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0019  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.682883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0028  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19940  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.53121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  93.94 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t04  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0044  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>