207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0037 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  92.21 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  92.21 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0035  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.15056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0023  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0001  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  89.13 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0023  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0012  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000181787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0339  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0351781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2596  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000276019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0076  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.083212  hitchhiker  0.00562166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0580435  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105423  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1541  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.713195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0203  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00945827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1710  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2904  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1734  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2749  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0961  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0032972  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0212233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  94.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0051  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.430637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>