299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0041 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  92.86 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  92.86 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.86 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1429  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t27  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0049  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.488702  normal  0.899504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0028  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0964  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0491752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0050  tRNA-Met  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000143302  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0045  tRNA-Met  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0012    87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.735583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0035  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0055  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0037  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0033  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0035  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0041  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0048  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.085942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0050  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0037  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000950191  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>