63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0050 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0050  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000143302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95.35 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  95.35 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  95.35 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0064  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0065  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_R0081  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0039  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_R0080  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_R0082  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0059  tRNA-Met  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0045  tRNA-Met  85.92 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0010  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0033  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0012    84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.735583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0047  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0059  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0055  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0037  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA27  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.841539  normal  0.0659835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0035  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0018  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0035  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1171  tRNA-Met  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0006  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0343832 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0078  tRNA-Met  89.74 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376289  normal  0.616064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0065  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0008  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>