80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0036 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0047  tRNA-Met  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00127199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0050  tRNA-Met  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000143302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0001  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0062  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0374221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0015  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000125426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_641  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000945354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  84.93 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  84.93 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  84.93 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  88.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0008  tRNA-Met  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06650  tRNA-Met  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0162553  normal  0.0748507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 118 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  83.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  86 
 
 		 155 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0018  tRNA-Met  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0025  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 128 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>