89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0042 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  91.94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0038  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.63633e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0083  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0082  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0081  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0035  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0028  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0033  tRNA-Met  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0026  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.963171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0033  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0035  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1429  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0037  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0049  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.488702  normal  0.899504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  85.29 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0052  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125474  normal  0.521924 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0033  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0964  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0491752  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  92.31 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  92.31 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.31 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  92.31 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0027  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t27  tRNA-Met  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0049  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.443386 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557667  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0058  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000126264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0415147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0100  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293545  normal  0.0134461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0047  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>