10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0047 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0047  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00127199  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  83.82 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  83.82 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0028  tRNA-Ile  91.18 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.870581  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>