255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0049 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0043  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00459429  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0048  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.818398 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0023  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05871  hypothetical protein  89.29 
 
 		 432 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.791766  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60410  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60080  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.662949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t13  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t52  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA11  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000000654973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA23  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R72  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564318  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R83  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115902  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2542  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2330  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  86.76 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0006  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t15  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00592778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t23  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0032  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000864577  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t055  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t056  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t058  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  88 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  88 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0034  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000104343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0031  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000370273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0086  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000000910147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0085  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0079  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0080  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000136157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0081  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0082  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0083  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000154707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>