169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0030 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0043  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00459429  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0023  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0048  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.818398 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  87.04 
 
 		 155 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2542  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2330  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t056  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0018  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.50415e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0107  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000698154  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0108  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000827722  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0109  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069936  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0110  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000341458  normal  0.142626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0113  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0107  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00061714  normal  0.366999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0108  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.368852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0109  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0110  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000275049  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0111  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000310231  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0112  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  normal  0.38206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0113  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000217944  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0031  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000370273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0032  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000864577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0034  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000104343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0052  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421031  normal  0.358949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0053  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000170712  normal  0.532775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0030  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0032  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000114848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0033  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000129521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>