51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_tRNALysVIMSS1309193 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05871  hypothetical protein  100 
 
 		 432 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.791766  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0002  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0014  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0036  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0009  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2330  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt06  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000258702  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt011  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0172063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2542  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1182  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.618909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0071  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>