203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  96 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  95.16 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  90.16 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0013  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114392  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0075  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0104  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0001  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0004  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>