126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0004 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  88.89 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0013  tRNA-Lys  92.31 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01380  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0844385  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0053  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000949911  hitchhiker  0.00166028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  87.1 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  86.36 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  87.93 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  88.52 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  88.33 
 
 
75 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1973  hypothetical protein  96.77 
 
 
318 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  87.3 
 
 
75 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  54  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0052  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125474  normal  0.521924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0019  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00642302  normal  0.417435 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  87.04 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt44  tRNA-Lys  84.62 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.305367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0034  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0046  tRNA-Lys  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  86.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0056  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0044  tRNA-Lys  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243599  hitchhiker  0.00307567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176599  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905085  normal  0.99602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>