299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0004 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0018  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0004  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0048  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.780393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0028  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000473663  hitchhiker  0.000687264 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>