297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  94.67 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  94.67 
 
 
76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  90.67 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  93.1 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0004  tRNA-Lys  91.38 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  92.16 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0027  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0211133  hitchhiker  0.000000873105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  97.14 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0018  tRNA-Lys  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0075  tRNA-Lys  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  88.46 
 
 
78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  88.46 
 
 
78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  88.46 
 
 
78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.46 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01380  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0844385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  88.46 
 
 
78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.46 
 
 
73 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  88.46 
 
 
78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  88.46 
 
 
73 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0053  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  88.46 
 
 
78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>