226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01680 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  90.79 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  89.33 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  89.33 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  90.62 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  92.86 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  92.31 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  88.89 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0104  tRNA-Lys  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  87.69 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0001  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0053  tRNA-Lys  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000949911  hitchhiker  0.00166028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  90.57 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  90.57 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0075  tRNA-Lys  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0029  tRNA-Lys  89.58 
 
 
91 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0031  tRNA-Lys  89.58 
 
 
91 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00676578  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0002  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0004  tRNA-Lys  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  85.71 
 
 
76 bp  54  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  85.71 
 
 
73 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  84.51 
 
 
76 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0046  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144311  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0027  tRNA-Lys  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0011  tRNA-Lys  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000213973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0011  tRNA-Lys  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000344573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0082  tRNA-Lys  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  93.94 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  87.76 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0018  tRNA-Lys  88.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  87.76 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0083  tRNA-Lys  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0081  tRNA-Lys  84.06 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0028  tRNA-Lys  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0020  tRNA-Lys  84.62 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503685  hitchhiker  0.000000175517 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  91.67 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>