38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0034 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  87.1 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_641  tRNA-Met  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000945354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0015  tRNA-Met  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000125426  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0033  tRNA-Met  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0035  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00189879  hitchhiker  0.0000515743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>