177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0104 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0104  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  119  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  119  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0025  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0045  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0379079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0082  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0081  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0083  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0019  tRNA-Lys  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00642302  normal  0.417435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00236112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0028  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000473663  hitchhiker  0.000687264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0097  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0047  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>