56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_R0031 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00676578  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000110387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0059  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00316433  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000117241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  100 
 
 		 831 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0012  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna28  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.751931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>