63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0059 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0059  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00316433  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0053  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0061  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0004  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0007  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0050  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0079  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0020  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503685  hitchhiker  0.000000175517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0024  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00534379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0031  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00676578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0024  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000863518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0029  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0005  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.41956  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0032  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0007  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000317912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0024  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.538836  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0023  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000608658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2173  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.206805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0653  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0558  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0077  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0059  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0012  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0033  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0016  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000117241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0014  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000110387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0027  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0032  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25038  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0056  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0014  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.032449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>