39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0053 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0053  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0059  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00316433  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0050  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0007  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0061  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0004  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0079  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0020  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503685  hitchhiker  0.000000175517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0024  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00534379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0023  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000608658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0005  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.41956  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0032  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0024  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000863518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0024  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.538836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0007  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000317912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>