95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0021 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0052  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000609044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0052  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0040  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna28  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.751931  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0053  tRNA-Lys  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0032  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0110  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0149527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0058  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000107196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0056  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805133  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0059  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000131386  normal  0.0398666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0057  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000113368  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0058  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000101774  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0060  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000118562  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0054  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000293035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0847408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0035  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0013  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0083  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0073  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0026  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 573 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna129  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0002  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269854  normal  0.234293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0008  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747513  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0013  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0212264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0063  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000375232  hitchhiker  0.000000804387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0053  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000417582  hitchhiker  0.000449286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0012  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.00335239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0080  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000539724  normal  0.0299123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0072  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363339  hitchhiker  0.000159334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0067  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000429725  hitchhiker  0.000000544273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>