146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1159 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  92.75 
 
 		 78 bp  97.6  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  92.75 
 
 		 78 bp  97.6  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0053  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0007  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0040  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.17215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0149527  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0056  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805133  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0059  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000131386  normal  0.0398666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0057  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000113368  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0058  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000101774  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0060  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000118562  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0054  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000293035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0058  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000107196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0110  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0013  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Undet-2  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00119652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0002  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000230131  normal  0.891298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0017  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000962066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0080  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000338502  normal  0.0447756 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0002  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000350772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3108  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3542  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000176081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3771  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>