299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_AR0063 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  98.63 
 
 
77 bp  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  98.63 
 
 
77 bp  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t04  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0075  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0008  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0090  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  91.53 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0021  tRNA-Met  92 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.715825 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0026  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  89.47 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  85.53 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0020  tRNA-Met  90.38 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126987  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0026  tRNA-Met  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.234084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna2  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.119286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  91.49 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  87.93 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  89.66 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  89.66 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  89.66 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  87.93 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  89.66 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  89.66 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  92 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  90.57 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  90.57 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  94.59 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0016  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0003  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0503535  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0012  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>