186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06700 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  94.12 
 
 
77 bp  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  93.85 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0026  tRNA-Met  92.31 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.234084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  93.22 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0041  tRNA-Met  90.77 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  88.89 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16830  tRNA-Met  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0026  tRNA-Met  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0039  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474012  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  92.86 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0031  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0028  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.260556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0028  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882337  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0047  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.0740493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0049  tRNA-Met  86.11 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  86.11 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  92 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0032  tRNA-Met  92.86 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169141  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0043  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0041  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  0.246653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  89.47 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  87.72 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  89.47 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  89.47 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  89.47 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0025  tRNA-Met  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138308 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  93.02 
 
 
76 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0036  tRNA-Met  94.29 
 
 
75 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  94.29 
 
 
74 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  93.02 
 
 
76 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  90.2 
 
 
77 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  88.14 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  92.11 
 
 
72 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0066  tRNA-Met  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  87.72 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  85.96 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>