73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0036 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  96.97 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0032  tRNA-Met  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169141  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16830  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  90.14 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0039  tRNA-Met  89.39 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474012  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  89.39 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  90.32 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0022  tRNA-Met  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.09062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0049  tRNA-Met  87.88 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0078  tRNA-Met  89.47 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376289  normal  0.616064 
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0026  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.234084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  88.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  86.36 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0025  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0720614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0022  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0003  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3233  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0053  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0007  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000113693  hitchhiker  0.00181269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00354252  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0004  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0085  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00560229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_711  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.016147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0026  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0041  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747779  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0010  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0007  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0019  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0028  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882337  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0028  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.260556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0031  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>