62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0010 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0042  tRNA-Met  98.36 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna2  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.119286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1035  hypothetical protein  100 
 
 		 252 bp  79.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06650  tRNA-Met  90.32 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0162553  normal  0.0748507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t04  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0090  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0075  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0008  tRNA-Met  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09430  tRNA-Met  88.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.588566 
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  86.76 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0014  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170576  normal  0.370354 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0048  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0021  tRNA-Met  89.58 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114234  normal  0.0173767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0041  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  0.246653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0043  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0001  tRNA-Met  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.699138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16830  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0036  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>