41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_R0005 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0027  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  88.33 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0061  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0046  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0029  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000384489  normal  0.924155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0010  tRNA-Met  89.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0042  tRNA-Met  89.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0043  tRNA-Lys  84.85 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00459429  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  84.85 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0051  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106867  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0040  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.565678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0047  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna2  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.119286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0040  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0047  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2234  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0218563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2190  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0146062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0039  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0048  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0045  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0045  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0023  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0048  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.818398 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1934  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.810073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06650  tRNA-Met  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0162553  normal  0.0748507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  83.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  83.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  83.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>