37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2234 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2234  tRNA-Trp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0218563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2190  tRNA-Trp  100 
 
 		 78 bp  153  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0146062  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1670  tRNA-Trp  97.4 
 
 		 78 bp  137  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00343188  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208589  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1463  tRNA-Trp  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000838857  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1720  tRNA-Trp  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000880409  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0442  tRNA-Trp  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00029121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0044  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.910228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0055  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00911957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0004  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000305052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0052  tRNA-Trp  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0063  tRNA-Trp  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0021  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000328782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0013  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00030816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0011  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.053927 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0033  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0104  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000684472  hitchhiker  0.0000018986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0235767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0067  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0014  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.933511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0013  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.863904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>