73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1670 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1670  tRNA-Trp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00343188  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208589  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1720  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000880409  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1463  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000838857  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0442  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00029121  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2190  tRNA-Trp  97.44 
 
 		 78 bp  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0146062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2234  tRNA-Trp  97.4 
 
 		 78 bp  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0218563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0044  tRNA-Trp  90 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.910228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0055  tRNA-Trp  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00911957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0004  tRNA-Trp  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000305052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0013  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00030816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0021  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000328782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0063  tRNA-Trp  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0011  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.053927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0052  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0016  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000083767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0104  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000684472  hitchhiker  0.0000018986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0029  tRNA-Trp  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.263446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0014  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.933511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0235767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0013  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0067  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0015  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>