282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0008 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  98.28 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3462  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0068  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423507  normal  0.417359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0065  tRNA-Trp  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0927155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0069  tRNA-Trp  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0003  tRNA-Trp  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.7715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0018  tRNA-Trp  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0871425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0068  tRNA-Trp  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0067  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0011  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.155772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0013  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0015  tRNA-Trp  97.96 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256719  normal  0.0109238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0104  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000684472  hitchhiker  0.0000018986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  97.83 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  97.83 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0015  tRNA-Trp  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0544479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  90.77 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0048  tRNA-Trp  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798887  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  93.22 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0017  tRNA-Trp  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.66883e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0014  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.933511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0015  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0016  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>