More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0035 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  95 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0028  tRNA-Trp  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.718999  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0010  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000288959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0017  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000589441  hitchhiker  0.00131035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0010  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948194  hitchhiker  0.0000000000358204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0033  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.076955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  88.57 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0003  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.7715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0018  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0871425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0065  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0927155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0069  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0068  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0013  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00037699  normal  0.0920861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>