248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_R0098 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0104922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0089  tRNA-Trp  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0007  tRNA-Trp  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTrp01  tRNA-Trp  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0159  tRNA-Trp  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  92.59 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0024    92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.895934  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0029  tRNA-Trp  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0054  tRNA-Trp  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0023  tRNA-Trp  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0037  tRNA-Trp  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513006  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt029  tRNA-Sec  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0658058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0023  tRNA-Trp  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0044  tRNA-Trp  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000172694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0064  tRNA-Trp  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.829454  normal  0.0150036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0051  tRNA-Trp  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585976  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  90.74 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  90.74 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0032  tRNA-Trp  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  97.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0161  tRNA-Trp  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0037274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0160  tRNA-Trp  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00344423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0013  tRNA-Trp  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156686  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  93.18 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  97.22 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0067  tRNA-Trp  97.22 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt028  tRNA-Trp  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0028  tRNA-Trp  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.718999  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0017  tRNA-Trp  91.49 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.66883e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  94.74 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0056  tRNA-Trp  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0589076  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0645  tRNA-Sec  87.1 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0019  tRNA-Trp  85.71 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.77581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  87.72 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  86.89 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  86.89 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  87.72 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0011  tRNA-Trp  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.155772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  94.44 
 
 
78 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0003  tRNA-Trp  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.7715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0068  tRNA-Trp  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0018  tRNA-Trp  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0871425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0065  tRNA-Trp  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0927155  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0069  tRNA-Trp  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0014  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336426  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  94.29 
 
 
73 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4567  tRNA-Trp  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.926524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0019  tRNA-Trp  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805643  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0018  tRNA-Trp  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.392779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>