252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_R0045 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0685  tRNA-Trp  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000025208  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0051  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0060  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0006  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0057  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00401705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0054  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0028  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  95.65 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0013  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00037699  normal  0.0920861 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0024  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0037  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0024    92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.895934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0029  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0017  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000589441  hitchhiker  0.00131035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0054  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0023  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0033  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.076955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17320  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0032  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0017  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.735607  decreased coverage  0.0025473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0043  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29900  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0054  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0056  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0018  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  decreased coverage  0.00256285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0044  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0048  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798887  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0068  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423507  normal  0.417359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0015  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0544479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0056  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0589076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  90 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2420  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2130  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0055  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0015  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0064  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.829454  normal  0.0150036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0005  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0019  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805643  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0017  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>