264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0012 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  96.49 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0044  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000172694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0023  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0045  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000437445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0011  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.155772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0067  tRNA-Trp  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0014  tRNA-Trp  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.933511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0019  tRNA-Trp  94.44 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.77581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0069  tRNA-Trp  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0068  tRNA-Trp  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0065  tRNA-Trp  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0927155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0003  tRNA-Trp  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.7715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0018  tRNA-Trp  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0871425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0024    90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.895934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0029  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0054  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0023  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0037  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0048  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330801  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0068  tRNA-Trp  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423507  normal  0.417359 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0036  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000784105  unclonable  0.0000000173687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0048  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.798887  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0064  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.829454  normal  0.0150036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  85.53 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0013  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  93.02 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  93.02 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0015  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256719  normal  0.0109238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0015  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0544479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0685  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000025208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0032  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0056  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0589076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0016  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>