229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_R0130 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0110  tRNA-Trp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0033  tRNA-Trp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0301909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0135  tRNA-Trp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0129  tRNA-Trp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121569  hitchhiker  0.00785763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0045  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000437445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0078  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0018  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  decreased coverage  0.00256285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0024    87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.895934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0048  tRNA-Trp  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0029  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17320  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0054  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0017  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.735607  decreased coverage  0.0025473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0023  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0043  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0037  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0056  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29900  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0056  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0589076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0054  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0022  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.362458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0005  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0052  tRNA-Trp  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0051  tRNA-Trp  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0050  tRNA-Trp  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0064  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.829454  normal  0.0150036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0026  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.920402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0013  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000203485  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0053  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000643655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0006  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0868408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0017  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000751689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0019  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.77581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24010  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234408  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0685  tRNA-Trp  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000025208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0044  tRNA-Trp  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2420  tRNA-Trp  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2130  tRNA-Trp  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0017  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>