246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0007 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0823  tRNA-Trp  95.71 
 
 		 78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0144883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08690  tRNA-Trp  98.33 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000355239  hitchhiker  0.00161168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60050  tRNA-Trp  98.33 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0066  tRNA-Trp  98.33 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt07  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt07  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0041  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0009  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000520424  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0320  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000012562  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1869  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000841204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0015  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00419833  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0017  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225393  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t08  tRNA-Trp  95 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00447017  unclonable  0.000000239322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t08  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA66  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000464617  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R86  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0020  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0083  tRNA-Trp  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3462  tRNA-Trp  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0013  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000203485  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0006  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0868408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0017  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000751689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0026  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.920402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0053  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000643655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  94.23 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  97.73 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  97.67 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0052  tRNA-Trp  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0063  tRNA-Trp  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0010  tRNA-Trp  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948194  hitchhiker  0.0000000000358204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0011  tRNA-Trp  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.155772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0015  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0013  tRNA-Trp  95.65 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00030816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0010  tRNA-Trp  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000288959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08670  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000627266  hitchhiker  0.0000000142101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>