56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0016 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0016  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000083767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0004  tRNA-Trp  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000305052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna152  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna037  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2454  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1114t  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3141t  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.57879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3214t  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01015  tRNA-Trp  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00245  tRNA-Trp  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0044  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.910228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0029  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.263446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1720  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000880409  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208589  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0442  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00029121  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1463  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000838857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1670  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00343188  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTrp01  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0007  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0089  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0014  tRNA-Trp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0011  tRNA-Trp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.053927 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0011  tRNA-Trp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0104  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000684472  hitchhiker  0.0000018986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0017  tRNA-Trp  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.66883e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0161  tRNA-Trp  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0037274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0077  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0160  tRNA-Trp  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00344423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>