51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3141t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3141t  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.57879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3214t  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1114t  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01015  tRNA-Trp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00245  tRNA-Trp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2454  tRNA-Trp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna152  tRNA-Trp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna037  tRNA-Trp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0004  tRNA-Trp  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000305052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0016  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000083767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0029  tRNA-Trp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.263446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  91.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0160  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00344423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0161  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0037274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0034  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000403563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTrp01  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0016  tRNA-Trp  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000948806  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  82.43 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>