34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_R0016 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0034  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000403563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0016  tRNA-Trp  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000948806  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0029  tRNA-Trp  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTrp01  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0083  tRNA-Trp  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.687227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0044  tRNA-Trp  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1828  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.143602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0058  tRNA-Trp  87.67 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0052  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0010  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.474301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0043  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0043  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0045  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000437445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0046  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0058  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0921  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3141t  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.57879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3214t  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1114t  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01015  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00245  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2454  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna037  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna152  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0022  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.362458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>