18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0921 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0921  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1828  tRNA-Trp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.143602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1594  tRNA-Trp  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000895602  normal  0.474675 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0029  tRNA-Trp  94.87 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0044  tRNA-Trp  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0083  tRNA-Trp  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.687227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0071  tRNA-Trp  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0034  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000403563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0016  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000948806  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0083  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0109  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00430979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2566  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>