39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t2566 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t2566  tRNA-Trp  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0091  tRNA-Trp  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.901968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0047  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0043  tRNA-Trp  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0043  tRNA-Trp  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0109  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00430979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0087  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00552735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0113  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00198047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0096  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0108  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1594  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000895602  normal  0.474675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5741  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5715  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00259208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0869  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0609  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4562  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000250709  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4768  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0534  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2225799999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0794  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5680  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00328754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5703  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0685849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000188649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000236479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0228922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00498789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000185575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  86.36 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000102119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0083  tRNA-Trp  84.85 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0052  tRNA-Trp  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2419  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2129  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0921  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>