38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_R0087 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_R0087  tRNA-Trp  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00552735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0113  tRNA-Trp  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00198047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000185575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0609  tRNA-Trp  98.65 
 
 
76 bp  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5715  tRNA-Trp  98.65 
 
 
76 bp  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00259208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4768  tRNA-Trp  98.65 
 
 
76 bp  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0534  tRNA-Trp  98.65 
 
 
76 bp  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2225799999999998e-31 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  98.65 
 
 
77 bp  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00498789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  98.65 
 
 
77 bp  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0228922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  98.65 
 
 
77 bp  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000188649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5680  tRNA-Trp  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00328754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  98.59 
 
 
74 bp  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  98.59 
 
 
74 bp  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000236479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  98.59 
 
 
71 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000102119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  98.59 
 
 
74 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0685849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4562  tRNA-Trp  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000250709  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5741  tRNA-Trp  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0794  tRNA-Trp  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0869  tRNA-Trp  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5703  tRNA-Trp  98.59 
 
 
71 bp  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0047  tRNA-Trp  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0108  tRNA-Trp  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0083  tRNA-Trp  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0091  tRNA-Trp  96.97 
 
 
71 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0109  tRNA-Trp  94.37 
 
 
71 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00430979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0096  tRNA-Trp  94.37 
 
 
71 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  95.45 
 
 
71 bp  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  95.45 
 
 
71 bp  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.901968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0043  tRNA-Trp  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0043  tRNA-Trp  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2566  tRNA-Trp  87.88 
 
 
71 bp  67.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1594  tRNA-Trp  94.59 
 
 
71 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000895602  normal  0.474675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2129  tRNA-Trp  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2419  tRNA-Trp  96.55 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0052  tRNA-Trp  89.74 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183126  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0071  tRNA-Trp  84.48 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>