80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0067 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R04  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0047  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0108  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0096  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0083  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1594  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000895602  normal  0.474675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0087  tRNA-Trp  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00552735  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0921  tRNA-Trp  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0033  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0301909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0135  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519252 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0091  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0110  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0113  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00198047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0129  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121569  hitchhiker  0.00785763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0109  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00430979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0083  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.687227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0016  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000948806  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0044  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0029  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0034  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000403563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1828  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.143602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2566  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000188649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4768  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4562  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000250709  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0534  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2225799999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5741  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5715  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00259208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0228922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0869  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0609  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt028  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0794  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000236479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00498789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0685849  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.901968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000185575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000102119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0043  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0043  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5703  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5680  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00328754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0010  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.474301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0036  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000784105  unclonable  0.0000000173687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0053  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000643655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0013  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000203485  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0017  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000751689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0026  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.920402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0644  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0006  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0868408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>