143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0053 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0025  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0094  tRNA-Trp  89.39 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000691551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0564  tRNA-Trp  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08670  tRNA-Trp  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000627266  hitchhiker  0.0000000142101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0002  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0018  tRNA-Trp  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1212  tRNA-Trp  87.69 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0019  tRNA-Trp  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805643  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0063  tRNA-Trp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  86.15 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0003  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0873546  normal  0.535822 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0026  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0004  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0579339  normal  0.054785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000845148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0052  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0039  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.319425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4567  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.926524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1220  tRNA-Trp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0011  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00579096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0044  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0437713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0028  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0026  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0017  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0019  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00399304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0010  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00799791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATrpVIMSS1309078  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATrpVIMSS1309110  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATrpVIMSS1309199  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0988793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATrpVIMSS1309265  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATrpVIMSS1309154  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0830816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0012  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0160  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00344423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0161  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0037274  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATrpVIMSS1309351  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.839325  normal  0.990685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0019  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0044  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000172694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0023  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619868  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt028  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0011  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0014  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0024  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0036  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000784105  unclonable  0.0000000173687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0041  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0644  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0006  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0868408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0055  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000526045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>