58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0003 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0003  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0873546  normal  0.535822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0004  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0579339  normal  0.054785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0019  tRNA-Trp  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0012  tRNA-Trp  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0010  tRNA-Trp  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00799791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0028  tRNA-Trp  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0011  tRNA-Trp  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00579096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0019  tRNA-Trp  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00399304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0026  tRNA-Trp  98.51 
 
 		 73 bp  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATrpVIMSS1309199  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0988793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATrpVIMSS1309351  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.839325  normal  0.990685 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATrpVIMSS1309265  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATrpVIMSS1309110  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0044  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0437713  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0026  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0017  tRNA-Trp  97.01 
 
 		 73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATrpVIMSS1309078  tRNA-Trp  98.33 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATrpVIMSS1309154  tRNA-Trp  98.33 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0830816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  84.62 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0025  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0104  tRNA-Trp  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000684472  hitchhiker  0.0000018986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0033  tRNA-Trp  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04751  hypothetical protein  93.33 
 
 		 255 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.842794  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0017  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.66883e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06811  hypothetical protein  93.33 
 
 		 255 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>