152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t07729 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0007  tRNA-Trp  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0089  tRNA-Trp  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA38  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.997102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00066  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0108  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5198  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0861093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4122  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0092  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4107  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4323  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTrp01  tRNA-Trp  92 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4228  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4198  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000399283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4287  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4709  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5086  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4179  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4130  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.308865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0474  tRNA-Trp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0041  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.840083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0125  tRNA-Trp  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0562008  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0058  tRNA-Trp  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0361577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0037  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000710934 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0040  tRNA-Phe  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000293761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0039  tRNA-Phe  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.744114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0024    94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.895934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0037  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0029  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0051  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0054  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0023  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0098  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.772561 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0067  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0026  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0016  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.190715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0004  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0579339  normal  0.054785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0003  tRNA-Trp  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0873546  normal  0.535822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0003  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0017  tRNA-Trp  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.66883e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0044  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.1121e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0028  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0032  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0059  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000193701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4567  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.926524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0564  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0018  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1212  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0019  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805643  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>