65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0052 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0042  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0017  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0801926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0028  tRNA-Arg  90.77 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0043  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.473325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30020  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00306954  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0047  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0028  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0016  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0798603  decreased coverage  0.00114239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0067  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.74464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0055  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.763699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0049  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198977  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18410  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0950297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0065  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0045  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0009  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.184283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t28  tRNA-Arg  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122448  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0001  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.285544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0031  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.032059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0034  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102634  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0033  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000528096  normal  0.244498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0031  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1137 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13110  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0488167  normal  0.646736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_629  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1156  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.433457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0645499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t05  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0046  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.455447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0043  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924826  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.792463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0018  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0048  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358997  normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0043  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0046  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0809  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.770269  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0015  tRNA-Arg  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0016  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0012  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251285  normal  0.0396852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>