27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0037 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0037  tRNA-Phe  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000710934 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0063  tRNA-Phe  88.24 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0039  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.744114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0040  tRNA-Phe  90.91 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000293761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0006  tRNA-Phe  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0241224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0027  tRNA-Phe  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.293846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0041  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0028  tRNA-Phe  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  85.51 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0098  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.772561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0005  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  86.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0053  tRNA-Phe  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000574289  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0032  tRNA-Phe  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  normal  0.107554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225526  normal  0.0844719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>